Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lhx9Q9WUH2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms