Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lemd3Q9WU40 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lemd3Q9WU40 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lemd3Q9WU40 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lemd3Q9WU40 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lemd3Q9WU40 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lemd3Q9WU40 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lemd3Q9WU40 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms