Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU12

Snurf, SNRPN upstream reading frame protein, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnurfQ9WU12 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SnurfQ9WU12 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms