Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkraQ9WTX2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms