Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scn8aQ9WTU3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scn8aQ9WTU3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms