Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema6cQ9WTM3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms