Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TapbpQ9R233 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TapbpQ9R233 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TapbpQ9R233 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TapbpQ9R233 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TapbpQ9R233 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TapbpQ9R233 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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TapbpQ9R233 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TapbpQ9R233 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TapbpQ9R233 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TapbpQ9R233 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TapbpQ9R233 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TapbpQ9R233 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TapbpQ9R233 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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TapbpQ9R233 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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