Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sorbs3Q9R1Z8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sorbs3Q9R1Z8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms