Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6ap1Q9R1Q9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms