Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psma4Q9R1P0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms