Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubd1Q9R1K7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubd1Q9R1K7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubd1Q9R1K7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubd1Q9R1K7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubd1Q9R1K7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubd1Q9R1K7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubd1Q9R1K7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubd1Q9R1K7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubd1Q9R1K7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubd1Q9R1K7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubd1Q9R1K7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubd1Q9R1K7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms