Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slit2Q9R1B9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms