Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms