Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcm1Q9R0L6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcm1Q9R0L6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms