Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod1Q9R0E2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms