Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr54Q9R0D8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms