Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Gpc1Q9QZF2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Gpc1Q9QZF2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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Gpc1Q9QZF2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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Gpc1Q9QZF2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Gpc1Q9QZF2 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Gpc1Q9QZF2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Gpc1Q9QZF2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Gpc1Q9QZF2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpc1Q9QZF2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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