Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms