Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VapbQ9QY76 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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