Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Irx4Q9QY61 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx4Q9QY61 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms