Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms