Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkp3Q9QY23 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp3Q9QY23 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms