Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Opn4Q9QXZ9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Opn4Q9QXZ9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Opn4Q9QXZ9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Opn4Q9QXZ9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Opn4Q9QXZ9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn4Q9QXZ9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms