Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr2e3Q9QXZ7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr2e3Q9QXZ7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms