Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf354bQ9QXT9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms