Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms