Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lsm4Q9QXA5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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