Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca3a1Q9QX15 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca3a1Q9QX15 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms