Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk1eQ9JMK2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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