Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sfmbt1Q9JMD1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms