Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rabgef1Q9JM13 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rabgef1Q9JM13 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rabgef1Q9JM13 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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