Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms