Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tlr5Q9JLF7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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