Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgm1Q9JLF6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm1Q9JLF6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms