Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gde1Q9JL56 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gde1Q9JL56 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gde1Q9JL56 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gde1Q9JL56 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms