Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hip1rQ9JKY5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hip1rQ9JKY5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hip1rQ9JKY5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hip1rQ9JKY5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hip1rQ9JKY5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hip1rQ9JKY5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hip1rQ9JKY5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hip1rQ9JKY5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hip1rQ9JKY5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hip1rQ9JKY5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hip1rQ9JKY5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hip1rQ9JKY5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hip1rQ9JKY5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hip1rQ9JKY5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hip1rQ9JKY5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms