Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ldb3Q9JKS4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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