Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrac1Q9JKP8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms