Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pole3Q9JKP7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pole3Q9JKP7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms