Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
AtrQ9JKK8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
AtrQ9JKK8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms