Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl39Q9JKF7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl39Q9JKF7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms