Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pard6bQ9JK83 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms