Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms