Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Smpd3Q9JJY3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Smpd3Q9JJY3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Smpd3Q9JJY3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smpd3Q9JJY3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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