Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scube2Q9JJS0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scube2Q9JJS0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms