Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc12a4Q9JIS8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc12a4Q9JIS8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms