Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl28Q9JIL2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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