Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA7

Sphk2, Sphingosine kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk2Q9JIA7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sphk2Q9JIA7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms