Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird1Q9JI57 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird1Q9JI57 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms