Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pus3Q9JI38 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pus3Q9JI38 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms